生殖器官不健全或發育不良。有的人先天性無卵巢,或卵巢發育不良,或卵巢損壞,不能產生雌激素和孕激素,因此子宮內膜不能發生週期性的變化,也就不會出現子宮內膜脫落,所以也就沒有月經來潮。也有的先天性無子宮,或子宮內膜發育不良,或子宮內膜損傷,即使卵巢功能健全,雌激素和孕激素的分泌正常,也不會來月經。
女孩6~9歲可從尿中查出去氫表雄酮(DHEA)及其硫酸鹽,10歲起迅速升高,此乃腎上腺功能初現的表現,來源於腎上腺的雄激素促使陰毛、腋毛出現,身材迅速長高,因為下丘腦-垂體-卵巢軸尚待進一步發育完善,雌激素水準尚低,子宮內膜增殖較差,還不會引起出血,故月經推遲來潮。初潮前這一階段未見月經來潮屬於生理現象,有些女孩在初潮後尚有一年半載的月經數月來潮一次,且為無排卵月經也屬正常。
母乳餵養的婦女在任何時候斷奶,則常在斷奶後2個月恢復月經。
絕經過渡期可能數月出現一次子宮出血,絕經後生殖器官逐漸萎縮,子宮也縮小。